BIOLOGIA DEGLI RNA NON CODIFICANTI
2° Anno - Primo Semestre
Frequenza Non obbligatoria
- 6 CFU
- 48 ore
- INGLESE
- Sede di Trieste
- Obbligatoria
- Convenzionale
- Scritto
- SSD BIO/11
- Caratterizzante
In accordo con i principi dei "Descrittori di Dublino" per i Corsi di Laurea Magistrale, il corso si propone di consentire agli studenti di dimostrare: D1. Conoscenza e comprensione: Sviluppare una conoscenza approfondita dei processi fondamentali della biologia dell’RNA, con particolare attenzione agli RNA non codificanti nel contesto della biologia cellulare, dello sviluppo e delle malattie. Acquisire competenze nelle principali tecniche utilizzate nella ricerca sull’RNA. Coltivare la capacità di progettare strategie sperimentali e ideare nuovi approcci terapeutici basati sugli RNA non codificanti. D2. Capacità di applicare conoscenza e comprensione: Gli studenti saranno in grado di integrare le conoscenze acquisite in contesti scientifici più ampi e di confrontarsi criticamente con la letteratura scientifica attuale. Un’attività centrale nell’applicazione delle conoscenze è rappresentata dalla preparazione di presentazioni scientifiche in cui gli studenti introducono un ambito della ricerca sugli ncRNA, supportato da una pubblicazione scientifica di alto impatto. D3. Autonomia di giudizio: Gli studenti svilupperanno la capacità di analizzare criticamente la letteratura scientifica attuale relativa alla ricerca sugli RNA non codificanti e di individuare strategie per ampliare le conoscenze nel campo. L’autonomia di giudizio è stimolata attraverso le presentazioni degli studenti, che prevedono l’interpretazione di dati sperimentali. Tale competenza è ulteriormente rafforzata durante la preparazione dell’esame, che richiede una rielaborazione individuale dei contenuti trattati a lezione. D4. Abilità comunicative: Gli studenti presenteranno argomenti scientifici ai colleghi attraverso presentazioni orali, imparando così a utilizzare un linguaggio scientifico appropriato e a comunicare dati complessi sia a specialisti che a non specialisti. D5. Capacità di apprendimento: A partire dalle conoscenze fornite, gli studenti svilupperanno la capacità di ampliare autonomamente le proprie competenze nel campo della ricerca sugli RNA non codificanti, utilizzando fonti scientifiche adeguate. Questa competenza è stimolata attraverso l’uso di pubblicazioni scientifiche originali su scoperte chiave e tramite le presentazioni degli studenti.
Gli studenti devono avere conoscenze di base di biologia molecolare, espressione genica e biochimica. No sono previste propedeuticità
Il corso si integra con gli obiettivi formativi del Master in Genomica Funzionale fornendo conoscenze avanzate sulla funzione degli RNA non codificanti negli organismi superiori. Il corso affronta la funzione degli RNA non codificanti nel controllo dell'espressione genica, dell'epigenetica, della compartimentazione nucleare, della stabilità del genoma nel contesto della normale fisiologia cellulare e della malattia. Il corso ha un forte carattere interattivo, applicato attraverso seminari tenuti dagli studenti sulle attuali e importanti scoperte nel campo degli RNA non codificanti pubblicate su riviste scientifiche di alto profilo. Argomenti del corso: 1.L'evoluzione del genoma dell'RNA non codificante 2. Famiglie di RNA non codificanti 3. Gli RNA non codificanti nello sviluppo e nella malattia 4. Strutture subnucleari delle proteine RNA 5. piRNA 6. lncRNA 7. miRNA e ceRNA 8. RNA riparatori dei danni al DNA 9. eRNA 10. Editing dell'RNA 11. Funzione UTR degli RNA 12. RNA non codificante e compensazione del dosaggio 13. Ibridi RNA:DNA
Diapositive delle lezioni, reviews e pubblicazioni scientifiche sugli argomenti attinenti. Queste informazioni saranno rese disponibili su Moodle federato o MS Teams.
Il corso si integra con gli obiettivi formativi del Master in Genomica Funzionale fornendo conoscenze avanzate sulla funzione degli RNA non codificanti negli organismi superiori. Il corso affronta la funzione degli RNA non codificanti nel controllo dell'espressione genica, dell'epigenetica, della compartimentazione nucleare, della stabilità del genoma nel contesto della normale fisiologia cellulare e della malattia. Il corso ha un forte carattere interattivo, applicato attraverso seminari tenuti dagli studenti sulle attuali e importanti scoperte nel campo degli RNA non codificanti pubblicate su riviste scientifiche di alto profilo. 1. L’evoluzione del genoma RNA non-codificante. 2. Un quadro generale sulle famiglie di RNA non-codificante: miRNAs, lncRNAs, rasiRNAs, piRNAs, eRNAs, small RNAs correlati alla risposta al danno al DNA. 3. Gli RNA non codificanti nello sviluppo e nella malattia. Il coinvolgimento degli RNA non codificanti nel meccanismo della patologia verrà affrontato presentando studi chiave. 4. Strutture subnucleari dell'RNA-Proteina. Il ruolo degli RNA non codificanti nella definizione di domini di cromatina o strutture subnucleari rilevanti per la fisiologia cellulare. 5. piRNAs e il controllo di Trasposoni nella linea germinale dei mammiferi e della Drosophila. 6. IncRNAs, gruppi eterogenei di ncRNA e il loro ruolo nelle malattie. 7. miRNA/ceRNAs: l'interazione degli miRNA e degli RNA endogeni nel controllo dell'espressione genica. 8. DNA damage response RNAs (DDR): la loro formazione e il loro ruolo nel mediare una efficace segnalazione dai siti del danno al DNA. 9. Enhancer RNAs: la loro formazione e la loro funzione. 10. RNA editing: modificazioni chimiche degli RNA e la loro funzione biologica. 11. Il ruolo delle regioni non tradotte degli mRNA nel controllo dell'espressione genica 12. RNA non codificanti e compensazione del dosaggio in D. melanogaster e mammiferi. 13. RNA: DNA hybrids nel controllo dell'espressione genica e stabilità genomica
Il corso è diviso in due parti. Il Prof. Schoeftner terrà 20 ore di insegnamento frontale focalizzate sul ruolo dei meccanismi mediati dall’ RNA e dagli RNA non-codificanti nello sviluppo e nelle malattie. Nella parte iniziale del programma verrà dato un quadro generale delle varie categorie degli RNA non-codificanti. Il programma si focalizzerà, in particolare, sulle malattie correlate agli RNA non-codificanti facendo riferimento a pubblicazioni recenti sulla biologia degli RNA non-codificanti. Nella seconda parte del corso, gruppi di studenti (ca. 3 persone) esporranno una lezione che comprenderà i) una parte introduttiva sulle caratteristiche della classe del ncRNA scelto e ii) una pubblicazione sperimentale che ha contribuito ad ampliare le conoscenze sulle funzioni dell’ncRNA. Tutte le lezioni verranno fatte in inglese. Le lezioni classiche del docente e quelle preparate dai gruppi di studenti sono supportate da presentazioni in PowerPoint. Le diapositive, le pubblicazioni rilevanti o le recensioni relative agli argomenti della lezione sono accessibili agli studenti tramite la piattaforma Moodle federata/MSTeams.
1. Seminari per studenti: Con il supporto del docente, i gruppi di studenti selezioneranno una pubblicazione di alto profilo nel campo della biologia degli ncRNA. Successivamente, gli studenti effettueranno una ricerca autonoma della letteratura per identificare reviews e/o altre pubblicazioni di supporto e prepareranno una presentazione in PowerPoint. La presentazione in PowerPoint deve contenere una sezione introduttiva che spieghi il background del rispettivo argomento scientifico. Nella seconda parte, gli studenti presenteranno in dettaglio l'ipotesi di lavoro della pubblicazione scientifica selezionata e spiegheranno metodologie, risultati e conclusioni. È necessario discutere la rilevanza dei risultati della ricerca e le prospettive future. La presentazione orale in lingua inglese deve avere una durata di circa 60 minuti. Dopo la presentazione gli studenti parteciperanno attivamente a una discussione scientifica con i colleghi presentatori. Il materiale per ogni presentazione degli studenti sarà disponibile su Moodle/MS Teams prima della rispettiva presentazione. In questo modo gli studenti avranno l'opportunità di studiare ogni argomento prima delle lezioni dei colleghi. Il calendario delle presentazioni degli studenti sarà preparato nelle prime due settimane del programma di lezioni. 2.Eventuali modifiche alle modalità didattiche indicate, necessarie per garantire l’applicazione dei protocolli di sicurezza in caso di situazioni emergenziali, saranno comunicate attraverso i siti web del Dipartimento, del Corso di Studio e dell’insegnamento. 3. Studentesse e studenti con esigenze particolari (ad esempio: persone con disabilità, lavoratrici/lavoratori, adulti non neodiplomati, genitori, detenute/detenuti, ecc.) che, in modo stabile o temporaneo, si trovino impossibilitati a seguire le lezioni in presenza, potranno fare richiesta di partecipazione da remoto. Tale richiesta, motivata e sotto responsabilità personale, dovrà essere inviata via email alla docente/al docente con congruo anticipo rispetto all’inizio delle lezioni. 4. Studentesse e studenti con necessità specifiche relative allo svolgimento degli esami (ad esempio in possesso di certificazioni DSA o per disabilità) sono tenuti a informare tempestivamente il docente e l’Ufficio Disabilità di Ateneo (disabilita.dsa@units.it) all’inizio del corso, al fine di pianificare adeguatamente le modalità di valutazione dell’apprendimento.
La valutazione delle prestazioni degli studenti si basa sulla qualità della lezione presentata (punteggio: 0-16 punti). Introduzione: 0-5 punti; Sezione dei risultati relativi all'articolo scientifico: 0-5 punti; Conclusioni e prospettive future: 0-3 punti; Discussione: 0-3 punti. I punti rispettivi nelle diverse sezioni saranno assegnati in base alla chiarezza della presentazione orale, al grado di preparazione degli studenti e alla qualità delle diapositive preparate. La valutazione della lezione presentata da un singolo studente sarà valida per 2 anni accademici. Inoltre, verrà effettuato un esame orale che contiene 3 domande relative agli argomenti presentati durante tutte le lezioni del corso (punteggio: 0-5 punti per domanda). Nell'esame orale saranno valutate le conoscenze acquisite, ma anche la capacità di interpretare i dati scientifici e di inserire i risultati/dati scientifici in un contesto più ampio. Voto finale dell'esame: somma della valutazione della presentazione (0-16 punti) e dell'esame orale (0-15 punti). 31 punti corrispondono a 30 con lode (30L); per superare il corso è necessario un minimo di 18 punti. Codice di valutazione: 30L-30: Lo studente/La studentessa ha una conoscenza approfondita dei contenuti del corso, è in grado di fare collegamenti tra i diversi argomenti, di applicare le conoscenze teoriche alle applicazioni pratiche, di formulare nuove idee e di esprimere le risposte alle domande d'esame in modo efficace, chiaro e scientifico. 28-29: Lo studente/La studentessa ha una conoscenza approfondita dei contenuti del corso, sa fare collegamenti tra i diversi argomenti ed è in grado di esprimere le risposte alle domande d'esame in modo chiaro e scientifico. 25-27 Lo studente/La studentessa ha una buona conoscenza dei contenuti del corso, sa fare collegamenti tra i diversi argomenti ed è in grado di esprimere le risposte alle domande d'esame in modo chiaro e scientifico. 22-24: Lo studente/La studentessa ha una conoscenza media dei contenuti del corso ed è in grado di esprimere le risposte alle domande d'esame in modo chiaro e ragionevole. 20-22 Lo studente/La studentessa ha una conoscenza sufficiente dei contenuti del corso ed è in grado di rispondere alle domande d'esame in modo chiaro e ragionevole. 18-19: Lo studente/La studentessa ha una conoscenza sufficiente dei contenuti del corso. 0-17: non è sufficiente per superare l’esame. Gli studenti che non hanno presentato una lezione durante il corso non possono sostenere l'esame orale. Per sostenere l'esame orale è necessaria l'iscrizione a un "Appello" su Esse3. Gli studenti possono rifiutare il risultato dell'esame orale fino a 7 giorni dopo la data dell'esame stesso. Durante l'esame non è consentito l'uso di libri, dispositivi elettronici o copioni.
Questo insegnamento approfondisce argomenti strettamente connessi a uno o più obiettivi dell’Agenda 2030 per lo Sviluppo Sostenibile delle Nazioni Unite