Biologia molecolare clinica
3° Anno - Secondo Semestre
Frequenza Obbligatoria
- 1 CFU
- 10 ore
- ITALIANO
- Sede di Trieste
- Obbligatoria
- Orale
- SSD BIO/12
- Caratterizzante
Is part of:
Far acquisire allo studente le informazioni base sulle nuove tecniche diagnostiche, prognostiche e predittive per le principali patologie.
Promuovere la formazione di competenze nell'ambito della gestione dei laboratori biochimico-molecolari.
Far sviluppare capacità critica nell'affrontare le problematiche legate alle diagnosi di primo e secondo livello.
Conoscenze di biologia, biochimica e biologia molecolare
Introduzione al corso. Le emoglobinopatie e la loro diagnosi biochimico-molecolare. La leucemia mieloide cronica come esempio di diagnosi molecolari per le receidive.HPV test e NGS, come cambia la richiesta di diagnostica virale sui genotipi. Il tumore al polmone e le cure: la diagnosi molecolare per NSCLC EGFR.Le nuove frontiere della diagnostica molecolare per il tumore della mammella e il suo trattamento: PD-L1, TNBC, NSCLC, OSNA. La terapia CAR-T
Non ci sono testi di riferimento pubblicati sui temi del corso. Verranno date agli studenti rassegne e pubblicazioni scelte dal docente.
Contenuti del corso, modalità di studio e di esame. Le emoglobinopatie: tipi di emoglobine dalla vita fetale a quella adulta.Le talassemie (alfa, beta, gamma,gamma/beta, HPFH) e le varianti emoglobiniche (HbS,HbC,HbE).Elettroforesi Hb per le varianti. Tecniche molecolari per le emoglobinopatie : digestione enzimatica, ASO probes (reverse dot blot e dot blot), GAP-PCR, ARMS e sequencing. Patogenesi dell'anemia falciforme e diagnosi molecolare (dot blot, LCR e sequenziamento). patogenesi delle beta-talassemie: morbo di Cooley, mutazioni. Diagnosi molecolare di beta-talassemia per mutazioni frequenti (reverse dot-blot e ARMS) per mutazioni rare (SSCP e analisi di sequenza). Patogenesi della leucemia mieloide cronica. Diagnosi flow chart: emocromo/morfologia, FISH, RT-PCR, RT-qPCR. le fasi croniche e le fasi avanzate.caratteristiche genetiche di BCR-ABL. Esame citofluorimetrico per blasti. Esami molecolari pr la traslocazione e la MMR. Monitoraggio della terapia con RT-PCR.Il virus HPV: biologia e ruolo causale con il cancro della cervice e di altre sedi.I tipi virali HPV oncogeni e non oncogeni. Il ruolo delle proteine HPVE6 e HPVE7 nella trasformazione delle cellule. le lesioni ad alto e basso grado. la patogenesi dell'infezione e il cancro della cervice. I vaccini HPV e le loro caratteristiche. incidenza infezione e temporalità manifestazione clinica. Linee guida vecchie e nuove per il pap-test e HPV test. Le analisi molecolari su HPV e le varie piattaforme: Qiagen hybrid capture2, amplicor HPV test, cobas HPV test. Tecnologie NGS; principi generali (primers, amplificazione e sequenziamento) e piattaforme. Il principio di amplificazione con illumina. Pirosequenziamento e Ion torrent. Il futuro NGS.Patogenesi tumori del polmone e fattori di rischio. Incidenza e mortalità. Il ruolo di EGFR in biologia e valore nella terapia NSCLC. EGFR e medicina personalizzata. I farmaci molecolari per le mutazioni di EGFR.Evoluzione dei test nelle targeted-therapies. Incidenza delle mutazioni EGFR. Il percorso di analisi molecolare di EGFR per NSCLC e il materiale biologico per analisi. tissue dissection e analisi molecolare mutazioni EGFR. Differenza tra tecniche di screening e tecniche a bersaglio molecolare. Il pirosequenziamento e la qPCR. La ddPCR e i vantaggi.Ruolo di PD-L1 per sfuggire al sistema immunitario. caratteristiche patogenetiche del TNBC. Il ruolo degli anticorpi monoclonali anti-PD-L1 per la cura dei tumori primari e di quelli metastatici. Espressione di PD-L1 nei tessuti in linfociti infiltranti e in cellule tumorali. PD-L1 e NSCLC. Linfonodo sentinella e diagnosi con OSNA. Comparazione OSNA con analisi istopatologica extemporaneo.Principio di OSNA: amplificazione citocheratina CK19 con RT-LAMP. Nomogramma OSNA e score %. La terapia CAR-T: preparazione dei linfociti programmati.Centri autorizzati. Vantaggi e limiti della CAR-T Therapy.
Lezioni frontali con ausilio di slides.
Discussione dei casi in classe.
Problem solving in classe per il workflow dei percorsi di laboratorio per diagnosi di primo e secondo livello.
Agli studenti saranno fornite le diapositive delle lezione e materiali didattici integrativi per studio individuale sulle tecniche molecolari di avanguardia.
Esame scritto con domande aperte su tutti gli argomenti trattati.
Verifica della capacità di contestualizzare in modo adeguato il problema diagnostico nel suo workflow.
Verifica della capacità comunicativa in termini di chiarezza espositiva e competenza scientifica.
Verifica della capacità di collegamento tra la diagnosi biochimica e quella molecolare.
uesto insegnamento approfondisce argomenti strettamente connessi a uno o più obiettivi dell’Agenda 2030 per lo Sviluppo Sostenibile delle Nazioni Unite. In particolare, spiega l'evoluzione dallo stato fisiologico a patologico dell'organismo umano in relazione all'ambiente in cui vive e alle scelte di stili di vita (prevenzione primaria), nonchè di prevenzione secondaria (diagnosi precoce). Inoltre, spiega l'intima connessione tra i viventi per il benessere degli ecosistemi. Infine tratta le biotecnologie applicate alla medicina, all'agricoltura, alla zootecnia e all'industria sottolineando i punti di forza, le debolezze e i rischi.